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肺癌治疗的转录表达谱如何分析

发布日期:2018-03-27

随着高通量技术的发展,大家越来越多关注应用多标记技术,协助肿瘤的分子分型,与佳个性化治疗的选择。肺癌治疗转诊后发现,CpG岛甲基化表型(CIMP)筛选,可以检测信号通路调节因子的沉默,产生癌变通路激活。

肺癌治疗转诊机构爱诺美康介绍,为了检测耐药性的机制,可以检测化疗药物处理前后甲基化表观改变,进而可能改善其他药物药效,例如甲基化药物temozolomide就是基于MGMT基因启动子甲基化状态而开发的。转录表达谱分析,为了得到患者肿瘤组织个性化的转录指纹信息,转录组表达谱包括信使RNA(mRNA)、微RNA(microRNA,miRNA)和非编码RNA(non-coding RNA)信息。

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转录组学信息,可用于独特分子亚型的分类、预后评估、预测肿瘤治疗反应性。此外,在新型辅助系统治疗前后,对肺癌治疗的转录表达谱分析,可以提供治疗效果的关键信息。以及调节通路和生物过程,揭示新的潜在的治疗靶点。

肺癌治疗转诊的其他技术,例如外显子结阵列、基因组平铺阵列,利用每个基因的预期剪接位点的探针,检测基因外显子的异构剪切。RNA大规模平行测序(RNA-seq)受到越来越多的关注,RNA为基础的技术正在迅速的发展。

相对于传统的微阵列转录谱分析,RNA-seq不仅能够检测RNA水平表达,还可以检测癌症转录组上的异常,包括异常剪切、新的转录本和融合基因。肺癌治疗转诊机构爱诺美康介绍,此外,以RT-PCR为基础的多重检测,例如Oncotype Dx,在评估选定区域的RNA表达上越来越普遍。