去美国看病 探针的强度值会导致假阳性
发布日期：2018-03-05研究发现，染色体免疫沉淀（ChIP）能够检测转录因子结合位点，通过甲醛固定和超声处理，使DNA和蛋白质进行交联，并降解掉未结合的DNA片段。感兴趣的蛋白被各自的抗体标记，以完成免疫沉淀过程。去美国看病服务机构爱诺美康介绍到，结合于这些蛋白的DNA被释放，然后使用微阵列（ChIP-Chip）分析。
有多种方法分析ChIP-Chip数据，平铺阵列的分析模型，通过参照GC含量探针序列和探针拷贝数量，来标准化探针。一些方法使用隐马尔科夫模型，而另一些则使用基于滑窗的方法，来判定ChIP的富集区。去美国看病后，直接使用每一种探针的强度值，作为潜在的DNA蛋白的相互作用点，可能会导致很高的假阳性。
因而滑窗方法，通常会被建议用来分析ChIP-Chip数据资料，这时固定的窗口沿着基因组移动，然后分析概括落入窗内的所有探针。任何从概括窗口方法得到的峰值，都将被认为是结合位点。类似的，微阵列能够研究表观遗传学的变化，和具体的DNA甲基化。甲基化的DNA片段能通过各种方法得以富集，DNA片段杂交于微阵列以行全面的检测。
去美国看病获得数据资料后，探针强度需要标准化。各种方法可以用来标准化甲基化数据，包括RMA（如前所述），其常常用来分析mRNA表达资料MAT和Potter，将信号强度、序列及所有探针的拷贝数量纳入标准化模型。相似于ChlP-Chip分析，滑窗方法通过基因组区域，来概括探针水平值。滑窗方法的选择依赖于信息资源、生物学则不变。
这些可以通过基于芯片或基于NGS的方法，识别为SNP甲基化敏感性限制性酶富集（MSRE），可以靶向甲基化或非甲基化DN。从而通过PCR扩增，分别富集非甲基化或甲基化片段。去美国看病后，RNA微阵列的出现，描述了过去20年所完成的很多实验研究，相对于以前的技术，例如反转录PCR（RT-PCR）、表达序列标签（EST）分析、基因表达的连续分析。RNA微阵列是更加有效及高通量的全基因组分析，然而RNA微阵列的根本缺陷，在于它只能测定排布于阵列上的探针的丰度。
因此，它无法获得特异同种型的表达、新转录因子的发现、非编码元件谱系、RNA序列变异的鉴定等相关数据。其中，特异同种 型表达和非编码元件谱系，能够通过比较少用的剪接/接合阵列和平铺序列，相结合的方法获得。
去美国看病服务机构爱诺美康介绍到，由于存在潜在的交叉情况，其准确性还不是很清楚随着二代测序技术的出现，RNA测序（RNA-seq）已经克服了这些问题，其可以同时测得DNA的所有转录本序列。被测序的RNA分子被命名为“读取序列”（长度依赖于测序技术，通常30~400bp）。因此，有助于确定所有RNA成分的结构和功能，其超出了已经注释的基因。
