去美国看病 蛋白质可使用重肽段作为标准
发布日期:2018-02-26经研究介绍,基于质谱的蛋白组学通常包括自上而下和自下而上两种方式。自上而下蛋白组学检测完整的蛋白或多肽,其不使用蛋白水解酶,并保留了整个分子的完整结构信息。自下而上的蛋内组学更多使用蛋白水解酶,如可剪切精氨酸和赖氨酸残基末端的胰蛋白酶消化为多肽片段。去美国看病后,这些肽段随后由液相色谱(LC)分离,并使用串联质谱(MS/MS)分析。
质谱分析获取的前体和产物,与每种多肽理论上的前体和产物进行比对,这些理论上的前体和产物是依据翻译后基因组数据库,和蛋白水解酶的特异性剪切位点推导而来。去美国看病服务机构爱诺美康介绍到,实验值与数据库中肽段的理论值进行匹配,在蛋白和多肽的检测匹配中有多种算法,并提供可信度。
一些被认为用于鉴定每种蛋白和多肽可信度的参数,包括匹配准确性、肽序列对应特定蛋白的单一性、重叠的或更长的肽序列以及肽序列,在一个样本中被识别到的次数。基于定量质谱的蛋白组学全面识别,并定量蛋白质以及靶向识别,是质谱蛋白组学的重要内容。去美国看病后,全面定量蛋白质水平,可以通过稳定同位素标记的蛋白质/多肽,使用重肽段作为标准,及非标记定量技术来获得。
去美国看病服务机构爱诺美康介绍到,同位素标记,可以通过代谢法即体内标记、化学法或者酶学法即体外标记。体内定量细胞培养氨基酸稳定同位素(SILAC),是一种体内技术,代谢法标记两种不同细胞群,培养基中缺乏 自然状态的氨基酸。细胞在有稳定同位素标记的氨基酸,重精氨酸、赖氨酸、亮氨酸或异亮氨酸的培养基中培养6〜7代。
两个细胞群,在代谢中分别将“轻”和“重”的同位素整合到细胞蛋白中,此后将两种细胞以1:1的比例混合,再进行蛋白水解并进行质谱分析。每个样本中相应的肽链通过液相色谱共洗脱,并通过对应配对的肽/蛋白质中“轻”与“重”,同位素比值进行相对定量。去美国看病后发现,这项技术要求活细胞培养几代,以致无法用于临床。