淋巴瘤治疗由于氧化会对核酸质量造成影响
发布日期：2018-02-26其他常见的肿瘤分子诊断，常用样本类型还有冰冻组织，及福尔马林固定的组织，后者可能装在福尔马林瓶中或包埋成蜡块。淋巴瘤转诊治疗后，比较这3种类型样本提取DNA的质量发现，冰冻组织即使在保存了很长时间（20年）后，依然可以提取出高质量的DNA。
如果样本用福尔马林固定6周以内包埋成蜡块，所提取的DNA质量和产量也可接受；福尔马林更长时间保存，则DNA质量和产量都是差的。福尔马林固定是病理学家处理标本首选的方法，因为，其可以通过大分子交联有效地保存原有细胞结构，便于显微镜下观察。然而，福尔马林却也可以造成DNA的变性，及DNA和RNA的破坏。淋巴瘤转诊治疗机制有很多，包括蛋白核酸交联导致的DNA及RNA片段化、核苷酸的化学修饰（碱基上添加羟甲基基团）、脱嘌呤作用，及产生某些不可逆的改变。
淋巴瘤转诊治疗机构爱诺美康介绍，FFPE样本里，提取到的核酸的质和量是大打折扣的，而且固定过程往往会造成低浓度的高度断裂的DNA/RNA（典型的是200bp左右片段），其可能含有患者肿瘤组织中不正确的核酸序列，导致终检测结果不真实。
为克服福尔马林的局限性，律议修改福尔马林固定流程。例如核酸产量偏低主要归因于蛋白核酸交联，及随后提取过程中核酸的捕获，可通过延长蛋白酶K消化时间至超过16h来改善，而不影响核酸的质量。福尔马林固定过程中的pH，偏酸性的固定液可以导致DNA降解，因此采用中性pH的固定缓冲液可以减少DNA降解。
已证实，磷酸盐缓冲液的福尔马林溶液，可以达到理想的固定效果和更好的RNA质量。淋巴瘤转诊治疗由于氧化作用，在石蜡中长时间储存也会对核酸质量造成影响，因此储存时间要尽可能缩短。定量RNA检测单个基因表达或全转录组分析，在肿瘤分子领域日趋流行。但正如上文所介绍的，福尔马林对DNA造成的有害影响，同样也会影响RNA。
因此，人们对利用FFPE样本进行RNA相关检测持怀疑态度。其主要问题是RNA上核苷酸的化学修饰，特别是mRNA的poly-A尾端的腺嘌呤核苷酸，会干扰后续的PCR反应，因为修饰后的腺嘌呤会降低离液剂。淋巴瘤转诊治疗后，进行RNA抽提的效率，而且还会降低 以oligo-dT做引物时逆转录的效率。
一些针对性的措施则可以避免这种情况，进而增加提取和逆转录的效率，如逆转录过程中使用随机引物法替代oligo-dT，使用蛋白酶K替代离液剂以逆转蛋白，与RNA间的交联以及采用70T，无福尔马林的缓冲液孵育RNA等。淋巴瘤转诊治疗机构爱诺美康介绍，因此，理解了福尔马林固定的局限性，并对固定和抽提方法做些改进，即可使提取的RNA质量达到实时定量PCR法，及基因表达芯片检测的要求。
