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淋巴瘤转诊治疗后如何采用突变检测方法

发布日期:2018-02-25

临床发现,焦磷酸测序在整个基因组扩增后,它能够有效地利用石蜡包埋的肿瘤组织和DNA样本,具有较高的灵敏度,甚至在炎性细胞丰富的肿瘤中,如在结直肠癌MSI中可以看到,或具有细胞核丰富机制的促结缔组织增生性胰腺癌,或以前治疗过、仅含有少量剩余肿瘤细胞。淋巴瘤转诊治疗后,采用一个简单、强大和高通M的突变检测方法,可应用于大型的流行病学研究和临床试验。可以准确地定量每个等位基因,从紧临焦磷酸测序引物的第一个核背酸,开始读取核苛酸序列,因此可设计相对小的PCR产物。

设计小的PCR扩增产物,对DNA降解特別有用,特别是来自石蜡组织中的DNA,其中的DNA通常是分裂成较短的片段。同时,双脱氧测序需要PCR扩增产物纯化。在得到PCR产物后,就没有必要再对焦磷酸测序,进行单独的净化步骤了。后,淋巴瘤转诊治疗在试剂和劳动时间方面,焦磷酸测序比双脱氧测序,更符合成本效益比。

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Ras基因家族(HRAS、KRAS、NRAS)是参与信号转导途径,活化的三磷酸鸟苷(GTP)结合蛋白。KRAS基因是一个常见的人类癌基,17%~25%的淋巴瘤转诊含有激活的KRAS突变。这些中的大多数是12、13密码子和2号外显子。这些突变使GTPase的活性受损,从而导致GTP抑制处于持续活化状态。在30%〜40%结直肠癌中,发现有激活的KRAS基W突变,从而引起通过丝裂原活化蛋白激酶途径细胞增殖,在非常早期的腺瘤中却很少发现这些突变,因为我们认为这种突变是在肿瘤发生发展的中间阶段获得的。

淋巴瘤转诊治疗机构爱诺美康介绍,EGFR通过相同下游途径对下游的有丝分裂产生影响。分子生物学研究表明,活化的EGFR、KRAS、BRAF和PI3CA突变可以激活KRAS突变,而这种突变可以绕过EGFR控制。很显然,KRAS突变的肿瘤患者不能从抗EGJFR治疗中获益。在美国临床肿瘤学会指南中,不推荐抗EGFR治疗用于KRAS突变的转移性结直肠癌。

此外,并非所有KRAS野生型患者会对EGFR抑制剂有效。淋巴瘤转诊治疗后,针对靶向治疗,需要更多的生物标志物以更好地辨别,对该治疗的有效者和无效者。由于大多数KRAS突变位于基因的离散区域,所以焦憐酸测序法是常用的临床检测方法。市售的KRAS基因的PCR试剂盒(DXS/Qiagen)可以检测KRAS 12和13密码子的7个主要突变。

一些修饰的检测,发现淋巴瘤转诊后,KRAS突变的扩增方法,例如,据报道在扩增阻滞突变系统Scorpion法,已增加了灵敏度,改善了KRAS基因测试结果的质量,为提高抗EGFR抗体的效果提供了动力。