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海外医疗 全基因组测序方法的流程

无论是选择一个有限的基因套餐，还是检测全部的基因，都要求这些位点能从较大的基因组中分离出来。稳定的方法是使用互补寡核苷酸，捕获目的基因。目标基因捕获的特异性，是通过设计寡核苷酸互补序列实现的，这种设计针对目标区域，同时去除重复序列。剪切基因组DNA，并加上连接物，是建立一个全基因组文库的第一步。海外医疗准备好的DNA在溶液中，与一个长寡核苷酸引物池杂交，捕获到的片段利用生物素亲和素捕获模式被分离。

通过洗 脱捕获片段，而去除不需要的DNA。然后洗脱靶DNA，接着扩增，并用于测序。另一可选的方法是多重PCR，即对PCR引物在一个单独的反应管中进行反应，海外医疗的这个领域是一个活跃的发展领域，新方法和更稳定的方法，正在有规律地进入市场。

海外医疗从技术观点来看，全基因组测序方法是简单的，因为它避免了上述的分离目标区域这一步骤。这种更加简单的工作流程，可能仅需要较少的起始DNA。但如之前提到的，由于测序靶点更大，测序费用确实增加，但它也可为癌症诊断带来一个潜在的结果。对于肿瘤科医师来说，更多的基因组没有临床价值，而癌症基因列表虽切实可用，但稍微有点局限性。

扩大测序的范围就会牺牲测序的深度，而前者对治疗的帮助不大。另外，基因组分析也可能发现，对患者或患者亲属有意义的基因改变，然而这超出了当前快速癌症诊断的需要。海外医疗服务机构爱诺美康介绍到，美国医学遗传学和基因组学学院，近发布指南，推荐明确的偶然发现，应该在不断增加的基因列表里有报道，这些基因改变可能具有已知或预期的致病作用。

产生DNA测序数据，只是使用NGS进行分子检测的一部分内容。导出体细胞突变图谱的数据分析是非常复杂的，有关这些概念和挑战，近已有综述进行阐述。复杂的数据分析是NGS推广至临床常规应用的一个障碍。NGS平台销售商和其他独立的公司，正在积极提供数据分析的流水线，但数据増长迅速，要全面分析肿瘤基因组，仍缺少必需的工具。海外医疗过程中，校准一个参考基因组的测序读长，并确定单核苷酸的差别。这种基础分析也是非常复杂的，其复杂性来源于人类基因组多个区域具有高度的相似性。

一旦确定是体细胞突变，那么接下来的工作，便是研究突变的功能影响。许多检测到的突变超出了既往有注释的突变范围，这些已注释的突变有明确的功能影响，如某种激酶的激活。突变附近可能没有受到影响，甚至是失活表型。在一个海外医疗的肿瘤样本中，观察到任何高频突变，都有可能提示它对这种疾病的重要性，但如果没有功能研究的支持，这只是一个间接的推论。