深入研究肿瘤组织，才能找到更好地治疗方式
发布日期：2021-06-30当前临床，医生通过从患者身上采集组织样本来诊断癌症，他们通常将这些样本，固定在福尔马林中进行显微镜检查。在过去的20年中，还建立了遗传方法，可以更详细地表征肿瘤中的突变，从而帮助临床医生选择最佳治疗策略。
即使是微小的组织样本，也可用于检测蛋白质。来自亥姆霍兹协会（MDC）的柏林MaxDelbrück分子医学中心、柏林卫生研究所（BIH）、柏林慈善大学和德国癌症协会（DKTK）的一组研究人员，成功地分析了使用质谱仪、详细分析固定肺癌组织样本中的8，000多种蛋白质。
“使用我们开发的方法，可以在蛋白质水平对癌细胞的分子过程进行深入分析，并在日常临床实践中大量收集、和存储的存档患者样本中进行分析，”MDC和BIH蛋白质组学平台负责人PhilippMertins博士说。“即使是非常小的组织样本，例如通过穿刺活检获得的组织样本，也足以进行我们的实验。”
该研究发表在《自然通讯》杂志上，被认为是多模态临床质谱靶向治疗抗性（MSTARS）研究项目的重大成功，该项目由德国联邦教育和研究部（BMBF）资助。由Mertins和Charit病理学研究所的FrederickKlauschen教授领导的研究小组，已经能够证明，与经常研究但非常敏感的RNA分子不同，蛋白质在样品中保持稳定多年，并且可以精确地量化。
“此外，存在于肿瘤组织中的蛋白质，尤其能很好地映射疾病进展，”主要作者、博士生科琳娜·弗里德里希（CorinnaFriedrich）说。Mertins和Klauschen实验室的学生，“这是因为它们提供了一些信息，例如哪些促进或抑制肿瘤生长的基因在细胞中特别活跃。”
这些方法，有望帮助确定每种肿瘤的最佳治疗方法。从该团队对两种肺癌——腺癌和鳞状细胞癌的分析中，获得的图片也变得如此详细，因为研究人员不仅发现了细胞中存在的大量蛋白质，而且还量化了超过14，000磷酸盐。
在磷酸化的帮助下，磷酸化是一种调节磷酸基团、与蛋白质可逆连接的机制，细胞通过打开或关闭某些信号通路，来控制几乎所有的生物过程。
“因此，我们的论文为更好地了解肺癌、和其他类型癌症的疾病进展提供了良好的基，”Klauschen说，他与Mertins是该研究的共同通讯作者。他说，这将使为每位患者，找到最佳治疗方案变得更加容易。
Mertins还希望，对组织样本中蛋白质组的质谱分析，不仅为发现用于治疗决策和患者生存预测的新生物标志物铺平道路，还为发现可作为未来药物靶点的其他分子结构铺平道路。而且，根据研究人员的说法，新方法还有另一个优点：“我们的方法不仅适用于研究癌症，而且可以非常广泛地应用。”
例如，蛋白质组学平台已经成功分析了来自COVID-19患者的固定免疫细胞的蛋白质组。作者还提供了哪些质谱方法，最适合不同类型临床研究的指南。
MDC平台的下一个议程是，对额外的固定免疫细胞和固定心血管组织进行质谱分析，以确定是否存在蛋白质和磷位点。“这里的目的是，更好地了解传染病和心血管疾病，”默廷斯解释说，“这样有一天可能会，以比迄今为止更好的方式治疗这些疾病。”
