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多数基因突变也存在细胞呼吸不足的现象

当氧化磷酸化不足时，癌基因激活和抑癌基因失活，多是驱动酵解所必需的变化。这些变化，是疾病的效应而不是疾病的病因。

国外有资料强调，呼吸不全早于基因组不稳定性的发生，其中部分专家可能会争辩说，线粒体和细胞核这两种细胞器的受损，是癌症发生和发展的必要条件。然而，细胞核-细胞质转移实验表明，肿瘤细胞核转移至正常细胞质中，也能指导细胞正常发育。

但是，正常细胞核转移至肿瘤细胞质后，并不能指导细胞正常发育。这样的证据，反驳了癌症起源于核基因组缺陷的假说。也有更多信息，讨论说明了细胞呼吸不全，如何引起细胞核不稳定性。尽管细胞呼吸不足可以用来解释癌症起源、和发展过程中观察到的大部分现象，然而有意思的是，瓦伯格的概念或理论，并没有被主流的癌症生物学任何著作提及。

因为多数情况下，基因突变被用来解释癌症的起因，如果没有讨论能量代谢在癌症起源中的作用，就像没有讨论太阳在太阳系起源中的作用一样。而癌症基因论，只有当我们用细胞呼吸不足而不是其他因素（基因、病毒、异倍体等）去解释癌症的起源时，癌症的起源问题才能迎刃而解。相关情况，也只有在这样一个大的前提下，确定呼吸不足与癌症起源相关时，才能体现它的重要程度。