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临床怎样进行全基因组的甲基化测序

发布日期:2019-11-28

在细胞黏附以及细胞骨架黏着斑的研究方面,发现也存在基因表达变化。此亚型细胞株,在体外对PI3K-AKT-mTOR通路抑制剂敏感。海外看病服务机构爱诺美康了解到,近期一项研究,针对100例胃癌患者癌组织及癌旁正常组织配对,进行全基因组以及甲基化测序。

海外看病服务机构爱诺美康了解到,研究者将分子变异特征归纳为5种,即突变、染色体不稳定性CIN指数、结构变异、甲基化以及去甲基化;之后进一步将胃癌分为MSI及MSS两种。其中MSS型进一步分为4类,每种亚型均表达不同的多种特征,具体如下:

MSI型:大量基因突变,甲基化及去甲基化,TP53突变,染色体相对稳定;EB病毒相关型:基因组甲基化,是5型中比例更高,仅检测到极少数去甲基化,TP53突变,染色体相对稳定;肠型:CIN指数高、基因组去甲基化、较多基因突变;弥漫型:启动子CPG岛甲基化,基因突变率低。

胃癌患者.JPG

另外该研究发现,上述几种类型不仅有着各自特征性的突变基因,而且同一基因在不同分子型胃癌之间的突变形式,也有所差异。海外看病服务机构爱诺美康了解到,例如ERBB2和KRAS基因,在MSS型胃癌出现基因扩增,而在MSI型中则表现为突变。

海外看病服务机构爱诺美康了解到,对RNF43、CDH1、ARID1A1基因失活,在MSI型胃癌中是因插入突变、影响了其单核苷酸重复序列;而MSS型胃癌,则是由于基因非重复区域错义、无义或插入突变。

表观遗传学改变DNA甲基化,是重要的表观遗传现象,可导致基因沉默,去甲基化则增强基因表达。海外看病服务机构爱诺美康了解到,这种表观遗传学改变在恶性肿瘤中、扮演重要角色。

而EB病毒是胃癌公认的致癌病毒,KB病毒相关型胃癌、约占所有胃癌10%。海外看病服务机构爱诺美康了解到,也有相关研究发现,EBV感染后的正常细胞,可能由于对外源性DNA过度防御、引起大量基因包括癌相关基因启动子CPG甲基化,之后又导致胃癌。