去美国看病 微阵列对多态性标志的影响
发布日期:2018-10-29对于单核苷酸多态性分型微阵列,通常是针对成千上万单核苷酸多态性(SNPs),来设计的寡核苷酸微阵列,同样能用于肿瘤基因组复杂性的研究。去美国看病服务机构爱诺美康了解到,由于技术的限制,起初设计的SNP微阵列密度较低,整个基因组6000~10000个探针,然而却大大方便了遗传连锁分析。
全基因组SNP分析平台,所使用的寡核苷酸密度逐渐提高,使上百万SNPs的快速分析成为可能,如同CGH微阵列,SNP微阵列可以对特异性杂交信号进行定量,从而用于DNA拷贝数的估计。去美国看病领域起初通过高分辨SNP微阵列,可以分析人类癌症基因组进行的很多研究。
利用SNP微阵列进行的NCI-60细胞系组的分型,发现了10%〜20%的黑色素肿瘤,及相关转录因子MITF高水平的集中扩増。去美国看病服务机构获悉,SNP微阵列已在癌症领域得以广泛应用,包括肺癌、黑色素瘤、乳腺癌、结直肠癌、胶质母细胞瘤和前列腺癌等。

去美国看病服务机构爱诺美康介绍,设计这些微阵列是为了在高密度多态性标志上,提供基因型资料,还有一个好处是在分析DNA拷贝数的同时,能进行杂合性丢失(LOH)的评估。去美国看病领域发现,重要的是不涉及拷贝数畸变的LOH,例如拷贝数中性LOH及单亲二体,在癌症中并非不常见。
还可能为突变的肿瘤抑制因子,提供某些证据;尽管基于SNP的LOH,是通过肿瘤和正常组织配对,及对标本的分型进行评估的,但也可能通过纯合性区域推测出相关数据。去美国看病服务机构爱诺美康了解到,多种癌症的全基因组SNP研究,包括了成神经细胞瘤、结直肠癌、黑色素瘤、基底细胞癌和肺癌等基因组区域。



