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克利夫兰诊所 基因表达序列分析的技术优势

发布日期:2018-09-30

对于基因表达序列分析(SAGE),及cDNA文库的情况,它们通常是确定特定细胞,或组织中基因表达模式的全面的方法。克利夫兰诊所转诊机构爱诺美康介绍,基因表达序列分析(SAGE)是一种以测序为基础,用于全基因组表达频谱分析,和寻找差异基因的新技术。

克利夫兰诊所转诊机构爱诺美康了解到,此技术是以转录子(cDNA)上,特定区域的寡核苷酸序列作为标签(tag),来特异性地确定mRNA转录物,然后通过连接酶将多个标签(20〜60个),随机串联形成大量的多联体,并克隆到载体中,对每个克隆进行测序。

应用SAGE软件分析,可确定表达的基因种类,并可根据标签出现的频率,确定基因的表达丰度,构建SAGE文库。克利夫兰诊所转诊领域获悉,该技术可以同时反映正常,或异常等不同功能状态下,整个基因组基因表达的全貌。

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克利夫兰诊所转诊机构爱诺美康介绍,特别是提供了一种定量基因表达的分布图,而无须对基因性质和生物系统预先有所了解,不必依赖已知的转录信息,以往构建SAGE文库在技术上,存在一定的挑战。克利夫兰诊所转诊机构介绍,单个分子测序平台的建立,使得SAGE和其他序列标签,为基础的方法更易于完成。

应用SAGE文库,可比较来源于正常和肿瘤组织的不同类型,及细胞的基因表达差异。克利夫兰诊所转诊机构爱诺美康了解到,SAGE是国际癌症研究中心(NCI),资助的肿瘤基因解剖工程(CGAP)的一项技术,这一计划的目标是,建立各种组织来源的正常和肿瘤组织中,基因差异表达的目录。