安德森癌症中心 DNA芯片如何应对临床障碍
发布日期：2018-03-07海外研究，用芯片确认了4种主要的内在亚型腔面，分别是A型、B型、ER和PR阳性。与ER/PR/HER2阴性型（三阴性亚型）有较大程度上的重叠，并且显示基底细胞起源的特征。比如基底型角蛋R阳性，随后的研究确定了另外的亚型，主要是在基底细胞样亚型的异质性群体中。
安德森癌症中心转诊机构爱诺美康介绍到，实例包括低紧密连接蛋白的肿瘤，其特征在于通过类似于乳腺干细胞的基因表达谱，免疫应答基因特征，其特征在于雄激素受体（AR）阳性，和随后激活的信号通路。在乳腺癌领域，识別疾病的不同分子亚型有重大突破，因为这些表型背后的不同分子特性已被发现。
实际上，结合基因组拷贝数和基因表达，分析表明不同乳腺癌亚型之间的重现性DNA，拷贝异常（CNA）是不同的。安德森癌症中心转诊后，这些发现提高了我们对疾病的病理生理学的了解，而且它们表明乳腺癌的分子分型发展，沿着不同的遗传途径。此外，临床相关信息可以被溯源，因为这些CNA中的一些已显示要么是预后相关，要么是包括可能的治疗靶基因。
近期大规模的乳腺癌基因组二代测序（NGS）研究，突出了这个疾病的大量分子异质性。它们还将分子亚型和不同的突变分析联系起来，这反过来又可能提供新的治疗靶点。前面提到的固有的分子亚型，是通过DNA芯片平台鉴定的，这是其临床实施的障碍。安德森癌症中心转诊后，为克服这个障碍，已推荐用免疫组织化学（IHC）方法筛查。
然而，这些方法和芯片结果的一致性方面表明欠佳，重要的不确定性因素区别腔面A和B型。安德森癌症中心转诊发现，因为增殖相关的基因，是定义它们的关键因素。所以是一个连续变量，而不是一个二元的。而且，近标记的PR表达水平，已被推荐用来区分这两种亚型，免疫组化和芯片平台HER2阳性。
一致性的病例芯片方法，只有70%的存过表达。安德森癌症中心转诊机构爱诺美康介绍到，基底样亚型和三阴性表型之间，缺乏一致性。乳腺癌领域出现了越来越多的分子生物学数据，另外改善所谓“个体化癌症医疗”的各个领域 充满期望。也就是，更好的特征描述、改善的预后预测、准确预测治疗效果和敏感的监测疾病。
