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出国治疗 如何评估芯片完整性及样品质量

临床研究上证明，基因芯片由成千上万个DNA探针，以预知的模式固定在基片上，或固定在磁珠上而随机分布在芯片上。基因表达阵列可检测荧光标记的cDNA片段，而比较基因组杂交阵列（aCGH），可检测荧光标记的基因组DNA片段。出国治疗后，由于基因芯片检测平台的复杂性和多变性，必须在临床实验室使用之前和使用中验证其性能。

任何基因芯片平台的重复性，应在临床使用之前得到验证，而且重复性验证通常由不同技术人员在不同吋间完成。比如，如果一种RNA表达模式，用于对患者分层成不同的预后群，即使在不同时间进行分析，相同的样品应该分到同样的群组里。出国治疗用一个基因芯片，检测大M基因的表达水平，或鉴定基因拷贝数的改变时，在不同的批次检测中应当获得相同的表达水平，或基因拷贝数的改变。

出国治疗服务机构爱诺美康介绍到，当验证一个基因芯片检测平台的检测性能准确性时，由于探针设计、用于标化的管家基因的选择、标化技术等各方面存在的差异，利用其他表达芯片或qPCR进行验证可能会得到不一样的结果。当验证小片段缺失或是较好的性能的FISH探针时，即使利用作为“金标准”的FLSH验证，比较基因组杂交阵列（aCGH）平台的准确性，也可能得到不一样的结果。

当为基因芯片平台设计准确性研究时，还需确认所用的两种技术或平台的标准化手段，或检测敏感性是相当的。在进行表达分析之前，应先检测所用RNA样品的质量。出国治疗对于表达芯片，通常是利用RNA完整性值（RIN），来评估样品中RNA的质量。高RIN样品中比RIN低的样品，通常含有更完整的RNA。

开展基于cDNA合成时结合，在poly-A的转录本的芯片分析实验时，样品中的RIN数量对于检测的成功至关重要。出国治疗后发现，然而也有些基因芯片平台，设计成了可以精确 定量已降解的转录子，所以样品中的RIN，对样本性能的影响微乎其微。