专家确定了肾细胞癌中的剪接变异生物标志物
发布日期：2022-07-13有科学家正试图提高他们对透明细胞肾细胞癌发展的理解，以开发新的靶向治疗方法。在欧洲泌尿外科杂志上发表的一项新研究中，莫菲特癌症中心的研究人员确定了这种疾病类型的生物标志物，并开发了一种工具，可以根据生物标志物的表达来指示哪些患者的预后不良风险很高。
透明细胞肾细胞癌是一种复杂的疾病，由不同类型的基因突变引起，包括遗传性改变和偶发性改变。尽管有这些知识，但这些突变中没有一个能够用于开发有效的治疗方法。为了帮助更好地了解有助于透明细胞肾细胞癌发展的关键分子过程，Moffitt 研究人员开始研究替代信使 RNA (mRNA) 剪接变体，以确定它们是否在这种疾病中发生改变，以及这些变体是否可以用作患者的生物标志物结果。
mRNA 是 DNA 转化为蛋白质过程中的关键中间分子。DNA 在细胞核中转化为 mRNA。然后将 mRNA 用作模板，形成控制所有细胞和生理过程的蛋白质；然而，在 mRNA 转化为蛋白质之前，RNA 分子被剪接成不同的产物。这使得单个基因能够编码多种不同的蛋白质，选择性剪接是一个自然过程，但癌细胞可以劫持该过程，以产生有助于癌症发展和进展的剪接变体。
Moffitt 研究人员使用了一种新的筛选过程，从癌细胞系数据开始，然后用透明细胞肾细胞癌患者数据进行确认，以识别患者体内富集的剪接变体。他们确定了 16 个关键剪接变异，这些变异在透明细胞肾细胞癌患者中发生了改变，其中一些与疾病生物学和结果相关。研究人员还确定了几种剪接变体与改变的 DNA 修饰模式有关。
研究人员利用这些信息，创建了一个基于五个剪接变体的组合表达水平的生存风险工具。RNASET2 和 FGD1 的表达与不良结果相关，而 PDZD2、COBLL1 和 PTPN14 的表达与更好的结果相关。该工具能够根据总体和癌症特异性生存的低、中和高风险对患者进行分层。
研究人员进一步分析了透明细胞肾细胞癌肿瘤样本中的蛋白质表达模式，发现几种负责基因剪接的蛋白质在高危患者组中的表达、和蛋白质修饰模式发生了改变。“这些结果表明，改变的剪接变体可能在透明细胞肾细胞癌的发展中发挥重要作用，并代表患者预后的生物标志物，”研究作者、泌尿生殖肿瘤学系助理成员、医学博士 Brandon Manley 解释说。
