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Netflix 风格的算法可构建癌症基因组蓝图

发布日期:2022-06-22

使用人工智能,科学家们已经确定了癌症开始和生长时存在的 DNA 拷贝的结构、顺序和数量出现的 21 种常见错误。这些常见的错误,称为拷贝数签名,可以帮助指导医生进行反映肿瘤特征的治疗。

当您观看 Netflix 时,系统会生成有关您观看的电影和电视剧类型、观看频率以及您是否给它们“赞”或“赞”的数据。Netflix 使用一种算法来分析大量数据,在您观看的内容中找到模式,然后在您滚动浏览 Netflix 时推荐新的电影和电视剧。

癌症基因.jpg

由伦敦大学学院 (UCL) 的 Nischalan Pillay 博士和加州大学圣地亚哥分校 (UC San Diego) 的 Ludmil Alexandrov 博士领导的一组研究,构建了一个类似的算法,可以筛选数千行基因组数据并找出染色体如何组织和排列自己的常见模式。

然后,该算法可以对出现的模式进行分类,并帮助科学家确定癌症中可能发生的故障类型。使用该算法,科学家们从 9,873 名患有 33 种不同类型癌症的患者的完全测序的基因组中寻找模式。该算法识别了肿瘤中染色体结构和数量的 21 个常见错误,并将它们分类为不同的“类型”,称为拷贝数签名。

21 个拷贝数签名,将用于创建一个蓝图,研究人员可以使用该蓝图来评估癌症的侵袭性,找到它的弱点并为其设计新的治疗方法。

加州大学圣地亚哥分校副教授、该研究的共同主要作者 Ludmil Alexandrov 博士说:“癌症是一种复杂的疾病,但我们已经证明,在它开始时发生的染色体变化和它的生长方式之间存在显着的相似性。就像 Netflix 可以预测你接下来会选择狂欢观看哪些节目一样,我们相信我们将能够根据其基因组之前经历的变化,预测你的癌症可能会如何表现。”