13 个与癌症样本表观遗传变化相关的特殊基因
发布日期：2022-07-06根据挪威癌症登记处的数据，截至 2020 年底，挪威有 35,515 人被新诊断出患有癌症，超过 300,000 人已经被诊断出患有癌症。发展有关癌症原因和潜在过程的知识，是一项重要的公共卫生优先事项。
在挪威分子医学中心 (NCMM)，研究人员研究了 19 种癌症类型，以确定调节异常 DNA 甲基化的潜在分子参与者，这是一种与基因表达调控相关的 DNA 表观遗传修饰。他们观察到 13 种转录因子 (TF) 的表达与 TFBS 附近的 DNA 甲基化水平之间存在关联，这些转录因子是在 TF 结合位点 (TFBS) 与 DNA 结合以控制基因表达的特殊基因。
这 13 个 TF 中的每一个，都是根据它们与至少两种癌症类型中 DNA 甲基化水平变化的关联来选择的。他们的结果，发表在表观遗传学和染色质上。在人体内，有无数的基因过程涉及我们的 DNA，以促进健康发展。其中一个过程称为 DNA 甲基化——一种与基因表达调控相关的机制。
异常的基因表达模式与几种疾病有关，包括癌症。“DNA甲基化是与基因表达控制相关的自然过程。在正常情况下，你有一定的DNA甲基化模式，但这可能会被癌细胞劫持，结果显示出不同的（异常）模式，”研究员博士 Lemma 解释说。
Roza Berhanu Lemma 博士是 NCMM 的研究员，Anthony Mathelier 博士的研究小组，她的同事一直在研究癌症样本中DNA 甲基化模式、和转录因子基因表达之间的相互作用。“癌症患者经常报告异常的 DNA 甲基化模式，们想找出这种失调的机制是什么，并看看是否有转录因子参与调节这一过程，”Lemma 解释说。
他们发现了 13 个转录因子，其表达水平与 DNA 结合位点周围的 DNA 甲基化量相关。在这 13 种转录因子中，大多数是“先驱因子”，这意味着它们具有与 DNA 区域结合的特殊能力，而这些区域原本是无法进入和甲基化的。该团队的发现，有可能导致更好的癌症诊断和预后。
