海外医疗：有关癌症研究 SpUR 的新数据库
发布日期：2022-06-02由 KAUST 的科学家开发的交互式门户网站，为癌症研究人员提供了一个平台，可以询问基因非编码部分的 RNA 剪接、如何促进不同类型肿瘤的生长。新资源名为 SpUR（Splicing in Untranslated Regions），可在线免费获取，详细介绍了 1000 多个在癌症中常见的剪接事件。
这些剪接事件，位于蛋白质编码终止信号下游的 mRNA 非编码区域中。这些事件的位点和表达水平，对 10 种癌症类型和相应正常组织的近 8,000 个样本进行了分类和可视化。借助该工具，独立研究团队现在可以进一步探索个体剪接事件，在癌症发展和进展中的作用。
“这些事件可能成为学术研究人员研究癌症中 RNA 失调的候选者，”KAUST 计算生物科学研究中心代理副主任兼智能健康计划副主任高鑫说。“或者，它们可以作为开发基于 RNA 的抗癌药物的主要来源。”
计算机科学家高、博士后 Bin Zhang 和研究工程师 Adil Salhi 与新加坡癌症科学研究所的研究人员，合作创建了 SpUR 数据库。研究表明，基因下游序列的剪接在癌症中普遍存在，尤其是在与肿瘤侵袭相关的基因中。
因此，癌症携带更多这些基因重组事件的患者，往往具有较差的生存结果。作为原理证明，研究人员设计了称为反义寡核苷酸 (ASO) 的剪接转换剂，可以阻断 3' UTR 中的这种剪接过程。当给予肝癌细胞时，这些药物有助于抑制肿瘤生长。并且由于相同类型的剪接事件，在不同癌症类型中普遍表达。
