去美国看病 基因分型技术有望用于癌症研究
发布日期：2018-03-04十多年前，一项基于单碱基延伸，并利用双光子激发荧光来鉴定SNP的技术被开发出来，称为ArcDiaTPX技术。去美国看病后，该技术中的引物被固定在微粒上，进行单碱基延伸反应。根据模版DNA的不同，引物延伸反应生成一个被标记，或者不被标记的核苷酸。之后，通过单个微粒的双光子激发荧光进行基因分型。
该技术的可靠性和灵敏度，使用统计学工具“Z因子”进行评价，“Z因子”是考虑了筛选方法的信号区间和变异的一种简单的特征性参数。去美国看病后，这项技术用于低至中通量±0.5〜150bP测序长度，测序具有高灵敏度、无需分离和高性价比的优点。缺点是样品需要预扩增，并且每一个样品的检测时间较长。
去美国看病服务机构爱诺美康介绍到，快照基因分型技术和Sequenom分型系统，都被癌症研究机构广泛使用，并且有希望用于临床。值得注意的是，这些基因组测试仅能检测已知变体和癌基因的表达，并不能发现新的或额外的药物靶点。
纳米级流控技术的进展，是利用集成流体通路（IFC）进行高通量实时PCR。纳升规模的样品和试剂，被引导到数以千计的纳升规模的腔室，并进行不同的实时PCR。近日，Access Array特定基因区段捕获系统的发布，允许检索PCR产物以用于有针对性的测序。去美国看病过程中，该存取阵列系统可以对并行的24〜96个PCR样本，进行24~96个单重分析，耗时短而且试剂用量小，但精度高。
为证明这一技术的可行性，去美国看病的研究人员，对已拥有筛选试验结果、及细胞系的HapMap数据，前列腺癌、肺癌、结肠癌、卵巢癌（PLCO）的DMA基因分型样品，进行了分析。这种动态阵列基因分型系统的准确率高达99.5%，比iPLEX和GoldenGate分析更精确。
一项去美国看病的临床实验表明，该系统与TaqMan实时PCR，及Fluidigm平台的分析结果，具有99%~100%的一致性。基于磁珠芯片的基因分型研究，意味着通过数百到数千个样本，对每个个体进行几十万个SNP的基因分型，并通过逻辑数据分析构建因果关系。
目前，市面上高密度的芯片分析平台，其中一个便是GoldenGate基因分型分析，该技术使单个反应中的延伸，和扩增步骤的位点特异性复用程度很高。这一分析技术的有趣特点是，它直接对目的基因组DNA进行分析，去美国看病不需要提前进行PCR扩增。
