组蛋白修饰相关基因特征显示多发性骨髓瘤的预后价值
发布日期：2025-10-15研究核心结论
根据整合基因组和转录组数据的多组学分析，组蛋白修饰相关（HMR）风险特征在多发性骨髓瘤患者中具有独立预后价值。尽管多发性骨髓瘤治疗药物不断增加且发病机制存在异质性，但患者预后仍较差，HMR预后模型的开发有助于通过改善风险分层和指导个性化治疗来满足临床需求。该模型不仅提高了与临床参数结合的预测准确性，还与基因组不稳定性、肿瘤免疫微环境和药物敏感性相关联，凸显了其与疾病生物学和个性化治疗策略的潜在相关性。
研究主要内容
研究背景与目的
多发性骨髓瘤患者预后差，尽管有新治疗药物且发病机制有异质性。
开发HMR预后模型，旨在改善风险分层、指导个性化治疗，满足临床需求。
研究数据来源与处理
数据来源：基因表达和临床数据来自GEO数据库的GSE24080、GSE136337、GSE136324和GSE2658；RNA测序和体细胞突变数据来自MMRF - CoMMpass项目。符合条件的患者需有完整生存信息且总生存期超过1个月。
基因选择：提取HMR基因，与数据集检测基因交叉后，选择173个基因进一步评估。
模型构建：将七个基因纳入多变量Cox比例风险回归模型生成预后风险评分。HMR评分通过多元Cox系数加权的归一化表达水平的线性组合计算。基于对数秩检验，用survminer包确定将患者分为高、低风险组的最佳临界值，并将训练队列分位数应用于验证队列以保证跨队列可比性。
研究方法与评估
评估方法：使用Kaplan - Meier生存曲线和时间依赖性受试者操作特征（ROC）分析评估HMR风险评分的预后价值。进一步分析GSE136324的免疫浸润情况。
研究结果
差异表达分析
GSE24080数据集中鉴定出269个差异表达基因（DEGs），包括216个上调基因和53个下调基因。
MMRF - CoMMpass数据集中鉴定出663个DEGs，包括359个上调基因和304个下调基因。火山图显示上调和下调基因明显分离。
GO富集分析
生物过程主要与染色体分离和核分裂有关。
细胞成分中观察到纺锤体和染色体区域的富集。
分子功能与微管蛋白结合和微管结合显著相关。
KEGG通路分析：确定细胞周期是最显著富集的通路。
GSEA富集分析：与细胞周期调控和细胞增殖相关的基因集在高危组中显著富集，支持HMR评分与增殖活性增加的关联。
HMR风险评分与TMB的关联
生存分析表明，TMB较高的患者OS明显较差（P = 0.032），TMB是多发性骨髓瘤的不良预后因素。
HMR定义组中，高风险患者的TMB显著升高，TMB和HMR风险评分呈正相关（P = 0.00021），基因组不稳定性随HMR评分升高而增加。
体细胞突变分析：高危人群中KRAS、NRAS和TP53改变的频率较高，TP53突变尤其丰富。
研究人员观点
中国浙江绍兴人民医院的主要研究作者Juan Lyu博士称，研究开发并验证了一种新的多发性骨髓瘤HMR风险特征，该特征在多个队列中表现出独立的预后价值。HMR评分与临床参数的整合提高了培训和验证队列的预测准确性和临床决策效益。
