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安德森癌症中心:微列阵应用在临床中有望更多

发布日期:2017-09-13

安德森癌症中心目前拥有十个NCI优势研究项目的资助,包括脑瘤、胰腺癌、乳腺癌、膀胱癌、前列腺癌、白血病、卵巢癌、子宫内膜癌、肺癌和黑色素瘤。每年投资超过4亿美元进行医学基础研究,并且拥有最多的美国国家癌症研究院(NCI)资助研究项目。

中心拥有由肿瘤学家、内外科专家和护士组成的高度专业性的诊疗团队,该团队对各类的恶性肿瘤患者进行专业治疗,为患者提供先进的治疗方法,和参与临床试验的机会是安德森癌症中心胃肠肿瘤中心的使命,提高胃肠癌症患者的生存率和生活质量是中心的目标。研究中心专家正在努力寻找更好的治疗方法,以及可以尽早检测出胃肠癌症的更准确的诊断和筛查手段。芯片基因组是一种DNA微阵列,用于检测基因组拷贝数的变异,比基于染色体的比较基因组有更高的分辨率。

安德森癌症中心:微列阵应用在临床中有望更多

国外看病服务机构爱诺美康介绍到,探针和靶标可以通过测量荧光标记靶标。在微阵列中,探针合成后通过共价键结合在固相载体表面,比如玻璃或硅。芯片平台采用微珠代替大的固相载体,用于结合探针。微阵列也可以通过把寡核苷酸,直接合成在固相载体表面来构建。微列阵技术不仅用于基础研究,而且也用于病人管理。

到目前为止,两个微列阵分析已被FDA批准应用于临床。第一个是基于芯片分析针对乳腺癌病人进行个性化治疗。它为61岁以下的女性淋巴结阴性乳腺癌患者提供了一个预后分析。该分析方法可以检测70个基因的表达,包括调节细胞增殖和侵袭、转移、基质完整性和血管生成的相关基因。第二个是检测基因芯片,用于细胞色素基因的分型,它能指导医生选择最有效且副作用最小的药物。其使用的基因芯片检测193个等位基因,来确定是否具有两个基因型中的一个。检测27个等位基因来确定其是否具有四个基因型中的一个,从而对不同个体进行分类。

尽管微列阵技术是一个对基因表达,和基因分型分析强有力的工具,但是它的可靠性和重复性受到质疑。微列阵在不同的实验平台和实验室结果,有时会有显著不同,且重复性比较低。这种不可重复性可能是列阵的独特性,不同个体差异性以及应用的不同统计方法造成的。微列阵的第一个行业标准,是通过基因芯片表达协会公布的,即“微列阵实验的最小信息”。标准制定的目的就是提供足够多的实验细节,以便使得其他研究人员或技术人员能够重复出,已发表的基因微列阵得到的实验结果。可接受的重复性,可以通过使用适当的对照和遵循严格的程序以及标准实现。

国外看病服务机构爱诺美康介绍到,在不久的将来,微列阵技术有望在临床实践中应用得越来越多。直接DNA测序和下一代测序桑格DNA测序技术,是一种基于酶反应的技术。它采用DNA聚合酶在三磷酸脱氧核苷酸,存在时延伸寡核苷酸引物进行反应。关键原理在于除了三磷酸脱氧核苷酸外,还引人了三磷酸来终止DNA链的合成。

安德森癌症中心转诊机构爱诺美康介绍,一个被合成到延伸中的DNA链上后,由于缺失进一步的延伸反应无法继续,从而阻止了后续形成磷酸二酯键。这样的终止法需要一个单链的DNA模板引物。每种三磷酸双脱氧核苷酸,都被标记上不同的荧光染料。测序反应和毛细管电泳完成后,不同染料标记的DNA片段形成阶梯状,可以由自动化测序仪进行检测。