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出国看病 SNP位点的变异与整体生存有关

发布日期:2017-06-18

经过并行和独立的实验研究,功能未知基因Rrplb被确定为潜在的转移易感候选基因。首先,使用前面提到的方法,其在物理上被确定为一个位于17号染色体ECM eQTL联动高峰区域的基因。出国看病服务机构爱诺美康介绍到,此外,从这些eQTL测绘实验中获得的芯片数据表明,Rrplb的表达水平与转移预测ECM基因的表达水平高度相关,cRrplb在看似无关的第二系列酵母双杂交实验中也被识别,该实验被用来确定与先前所描述的转移效率调节剂Sipal相互作用的因子。

免疫共沉淀不仅证实了这种相互作用,也证明Sipal酶解RAP1 GAP的活性因这种相互作用而降低。为了进一步研究该基因在ECM基因的表达以及调节转移潜能方面的作用,在多个小鼠细胞系中异位表达Rrplb%。与ECM eQTL测绘实验的结果一样,过度激活邮比诱导多个转移预测ECM基因表达的失调。此外,从高转移性Mvt-1小鼠乳腺肿瘤细胞系中分离Rrplb表达克隆株并植入小鼠,可证明Rrplb能够抑制肿瘤的生长和肺转移。

Rrplb似乎也在人类种系水平对肿瘤进展发挥调节作用。具体来说,由芯片分析Mvt-1细胞系中Riplb异位表达诱导的基因表达标签,可以在一个资料完善的人类乳腺癌基因芯片库中准确地预测生存。为了确认Rrplb在种系编码转移易感性中的重要性,在两个分别来自南加州和马里兰州的乳腺癌群体中检测人类Rrplb基因上一个非同义编码多态性出现的频率。

出国看病 SNP位点的变异与整体生存有关

出国看病服务机构爱诺美康介绍到,这些研究证明RrplbSNP位点的变异与较低的远处转移发生率和更高的整体生存可能性有关。Riplb在生殖细胞水平调节转移潜能的确切机制目前尚不清楚,不过它与Sipal的相互作用以及对ECM成分的调节可能是其中的关键。Brd4作为ECM eQTL和转移易感性候选基因,研究相对深人的溴蛋白Brd4,是一种转录调节剂和有力的细胞生长调节剂。Brd4的作用之一是促进G2/M 期的转换,该作用依赖于Brd4与其结合物,即前面所描述的种系编码转移效率调节剂Sipal在细胞内的平衡。

与Rrplb —样,Brd4也是一个ECM eQTL候选基因,其定位与Rrplb和17号染色体eQTL连锁峰区域非常接近。Brd4在AKXD x PyMT乳腺肿瘤中的表达水平也与EMC转移预测基因的表达水平高度相关。最后,在高转移性Mvt-1细胞系中该基因的异位表达不仅可调节ECM基因的表达,而且可抑制乳腺脂肪垫植人后肿瘤的生长和转移。

然而,最重要的是,对异位表达Brd4的Mvt-1细胞进行芯片分析表明,Brd4诱导的基因表达标签可以用来在5个乳腺癌基因芯片库中准确预测生存。此外,同样的标签可以用来对雌激素受体(ER)阳性和淋巴结(LN)转移阴性的乳腺癌(传统观点认为复发风险低)患者进行进一步分类,以确定原发肿瘤切除后复发风险较高的个体。

众所周知,环境因素的暴露如香烟烟雾和乙醇会增加多种癌症的易感性。但这些因素也能调节转移潜能吗?事实确实如此,最近一项使用PyMT小鼠的研究表明,高脂肪饮食会增加肺转移的发生率。此外,该实验证明这些饮食因素与转移易感基因位点之间存在相互作用。这类研究说明在小鼠中除了准确模拟人类癌症特点外,模拟人群环境暴露特点也是非常重要的。

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