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去美国看病 基因表达的精确定量将得以应用

发布日期:2017-09-04

加州大学洛杉矶分校医学中心,建于1955年,于2008年更名为罗纳德.里根医疗中心。该院位于气候宜人华人众多的洛杉矶,下辖8所医院,在美国综合排名第五,美国西海岸综合排名第一,科研能力排名第四,先后有14人获得诺贝尔奖,艾滋病即于1981年在该院首次发现。

去美国看病服务机构爱诺美康介绍,该医学中心建设耗资8亿美元,可抵抗里氏8级地震,被称为“世界上技术先进的医院”。该院新建的医疗大楼,每一层都是按照某一特定专业所需,配备整套必要的支持设备和物资。每一层都有各自的药房、透析室、呼吸机辅助治疗室和住院医师的休息室,人性化的设计让病人免去了奔波的疲劳。每一个病房若有需要,都可以转换成重症监护病房,这样可以在同一个房间为重病人提供持续的照护。

手术室配备的是全视听集成系统及尖端医疗设备。拥有多个创伤病房和专业CT扫描仪的一级创伤中心,使医生一旦到达病房就能很快的知道病患出现的问题在哪。重症监护室采用“瞄准线”切入法以确保重症病患得到360度无死角的照护。

去美国看病 基因表达的精确定量将得以应用

同一研究基于同样的组织和芯片平台,也会发生重复性偏低的状况。低重复性被归咎于芯片技术本身的特点,使用者之间的操作差异,以及数据处理过程的差异等。针对这些问题,芯片基因表达数据协会制定了一套准则“芯片实验的小信息",这是早的一批芯片实验准则之一,旨在为研究者或技术人员提供足够的实验细节,从而帮助重现公开的芯片实验结果。  

近年来,芯片实验已经可以得到很有前景的数据,说明恰当的控制、严格的流程和标准的芯片分析过程能够保证可重复的数据。基于标签测序技术的转录组分析、或基因组区域,适当的计算软件能够给出全基因组范围的转录组数据。正是这样一个运用短序列标签进行表达谱分析的技术,适合研究驱动基因表达和非编码调控的转录调控。

然而,据估算,标签测序只能检测到细胞中60%的转录本。去美国看病服务机构介绍到,与芯片方法比较,标签测序有机会检测到未知转录本,并且能对基因表达进行单碱基分辨率的精确定量,同时背景噪声较低。已经广泛应用于寻找胃癌、卵巢癌和乳腺癌的生物标志物,但是它的成本是所有方法中昂贵的。

表达序列标签是与小片段cDNA特定互补,能够作为转录本应用。公共数据资源中包含了多个EST,可以通过物理图谱技术,将这些标签映射到特定的染色体区域。由于这些标签明确地指向特定转录本,基于大规模实时转录组分析,通常被认为是基因表达分析中的“金标准”,这是归功于它的检测敏感性。随后,技术发展检测通量扩大,可直接应用于基因表达谱分析。

目前,常用于基因表达谱检测的实时平台,是利用大范围的引物集合和探针集合,研究全基因组范围的表达谱,在一个微流体动态微阵列中检测超过2000个mRNA。去美国看病服务机构介绍到,检测体系包括两个序列特异的引物,和一个小槽结合的探针,后者包含荧光信号染料。该检测利用聚合酶的核酸酶活性,在水解结合到目标扩增子的特异探针,提供了两个层次的序列特异性。这个方法越来越多地应用于寻找肿瘤生物标志物,例如肝癌、黑色素瘤和膀胱细胞癌。